autoconf -- это утилита для автоматической
конфигурации разработанного вами программного пакета с целью их
работы на множестве различных UNIX-подобных систем. Вот основная
страница с информацией:
http://freshmeat.net/projects/autoconf/.
Алексей Отт <ott@phtd.tpu.edu.ru> перевел документацию на autoconf 2.13 на русский язык (к сожалению, это уже чрезвычайно устаревшая версия. Вам может пригодиться разве что описание общего подхода). Я помог ему, вычитав и отредактировав перевод.
Эта страница была сделана для того, чтобы предоставить все стандартные формы распространения документации GNU, а именно: